南海公园的长跑路线为滨湖环路—绕湖一圈—半圆路，共5km。整个长跑沿途配备了公共厕所，并且湖东岸及湖西岸都配有商业区，方便市民休憩。南海公园通过提升水功能、美化水环境、弘扬水文化、打造水景观，构建“城水相依、绿水相印、人水相亲”的水生态体系。

2020年1月1日在南海公园举办了盐城市迎新年长跑。

南海公园被评为盐城“最美跑步线路”，并且拥有江苏首条AI智慧健身步道，成立了南海公园跑步俱乐部。